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The persistent homology with coefficients in a field F coincides with the same for cohomology because of duality. We propose an implementation of a recently introduced algorithm for persistent cohomology that attaches annotation vectors with the simplices. We separate the representation of the simplicial complex from the representation of the cohomology groups, and introduce a new data structure for maintaining the annotation matrix, which is more compact and reduces substancially the amount of matrix operations. In addition, we propose heuristics to simplify further the representation of the cohomology groups and improve both time and space complexities. The paper provides a theoretical analysis, as well as a detailed experimental study of our implementation and comparison with state-of-the-art software for persistent homology and cohomology.
persistent cohomology - implementation - matrix reduction - data structure - annotation - simplex tree
The persistent homology with coefficients in a field F coincides with the same for cohomology because of duality. We propose an implementation of a recently introduced algorithm for persistent cohomology that attaches annotation vectors with the simplices. We separate the representation of the simplicial complex from the representation of the cohomology groups, and introduce a new data structure for maintaining the annotation matrix, which is ...

68Wxx

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Cet exposé présente un certain nombre d'exemples d'exercices de programmation sur les arbres qui peuvent être effectués dans les premières années d'université. Les programmes étant eux-mêmes des arbres, écrire des programmes qui opèrent sur des arbres permet d'écrire des programmes qui opèrent sur d'autres programmes.

68Wxx ; 68N15

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